MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum CAU B946

Total Repeats: 86144

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016784	TCTT	2	8	11	18	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016784	ACA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016784	CAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016784	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016784	CA	3	6	229	234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016784	TTG	2	6	246	251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016784	CTA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016784	GT	3	6	316	321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016784	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016784	AGG	2	6	393	398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016784	AT	3	6	419	424	50 %	50 %	0 %	0 %	375360691
12	NC_016784	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360691
13	NC_016784	CTGG	2	8	567	574	0 %	25 %	50 %	25 %	375360691
14	NC_016784	AT	3	6	607	612	50 %	50 %	0 %	0 %	375360691
15	NC_016784	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360691
16	NC_016784	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360691
17	NC_016784	A	6	6	697	702	100 %	0 %	0 %	0 %	375360691
18	NC_016784	ATCGG	2	10	775	784	20 %	20 %	40 %	20 %	375360691
19	NC_016784	GCA	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360691
20	NC_016784	TTTA	2	8	849	856	25 %	75 %	0 %	0 %	375360691
21	NC_016784	TA	3	6	855	860	50 %	50 %	0 %	0 %	375360691
22	NC_016784	GTG	2	6	940	945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375360691
23	NC_016784	TCT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360691
24	NC_016784	TCA	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375360691
25	NC_016784	ATA	2	6	995	1000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375360691
26	NC_016784	GAT	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360691
27	NC_016784	AACA	2	8	1079	1086	75 %	0 %	0 %	25 %	375360691
28	NC_016784	GAA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360691
29	NC_016784	CAAA	2	8	1131	1138	75 %	0 %	0 %	25 %	375360691
30	NC_016784	CCG	2	6	1159	1164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375360691
31	NC_016784	GATT	2	8	1214	1221	25 %	50 %	25 %	0 %	375360691
32	NC_016784	CCG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375360691
33	NC_016784	GAAA	2	8	1268	1275	75 %	0 %	25 %	0 %	375360691
34	NC_016784	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375360691
35	NC_016784	TCT	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360691
36	NC_016784	CAG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360691
37	NC_016784	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360691
38	NC_016784	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360691
39	NC_016784	GA	3	6	1644	1649	50 %	0 %	50 %	0 %	375360691
40	NC_016784	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360691
41	NC_016784	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360691
42	NC_016784	AGC	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360691
43	NC_016784	CAG	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360691
44	NC_016784	GAAA	2	8	1725	1732	75 %	0 %	25 %	0 %	375360691
45	NC_016784	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375360691
46	NC_016784	CTA	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016784	TAC	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016784	AT	3	6	1902	1907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016784	ATTAT	2	10	1910	1919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016784	AGG	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016784	TCG	2	6	2040	2045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360692
52	NC_016784	TCAT	2	8	2099	2106	25 %	50 %	0 %	25 %	375360692
53	NC_016784	AGA	2	6	2113	2118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360692
54	NC_016784	TGA	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360692
55	NC_016784	CGAT	2	8	2139	2146	25 %	25 %	25 %	25 %	375360692
56	NC_016784	TGC	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360692
57	NC_016784	TTC	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360692
58	NC_016784	A	6	6	2195	2200	100 %	0 %	0 %	0 %	375360692
59	NC_016784	AATTT	2	10	2271	2280	40 %	60 %	0 %	0 %	375360692
60	NC_016784	ATT	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375360692
61	NC_016784	CGT	2	6	2536	2541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360692
62	NC_016784	TGA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360692
63	NC_016784	TGG	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375360692
64	NC_016784	TTC	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360692
65	NC_016784	TCG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360692
66	NC_016784	CTT	2	6	2769	2774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360692
67	NC_016784	GA	3	6	2782	2787	50 %	0 %	50 %	0 %	375360692
68	NC_016784	CAA	2	6	2794	2799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375360692
69	NC_016784	TCA	2	6	2843	2848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375360692
70	NC_016784	TTCA	2	8	2920	2927	25 %	50 %	0 %	25 %	375360692
71	NC_016784	AT	3	6	2935	2940	50 %	50 %	0 %	0 %	375360692
72	NC_016784	ATG	2	6	3027	3032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360692
73	NC_016784	TGC	2	6	3086	3091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016784	TCA	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016784	T	6	6	3160	3165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016784	CGG	2	6	3285	3290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375360693
77	NC_016784	GAGC	2	8	3309	3316	25 %	0 %	50 %	25 %	375360693
78	NC_016784	CAA	2	6	3330	3335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375360693
79	NC_016784	CGC	2	6	3349	3354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375360693
80	NC_016784	GTC	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360693
81	NC_016784	GC	3	6	3483	3488	0 %	0 %	50 %	50 %	375360694
82	NC_016784	ATC	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375360694
83	NC_016784	GAAG	2	8	3649	3656	50 %	0 %	50 %	0 %	375360694
84	NC_016784	TGA	2	6	3659	3664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360694
85	NC_016784	A	6	6	3703	3708	100 %	0 %	0 %	0 %	375360694
86	NC_016784	AGC	2	6	3737	3742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360694
87	NC_016784	TCAG	2	8	3749	3756	25 %	25 %	25 %	25 %	375360694
88	NC_016784	GAG	2	6	3828	3833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375360694
89	NC_016784	A	6	6	3899	3904	100 %	0 %	0 %	0 %	375360694
90	NC_016784	AGC	2	6	3999	4004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360694
91	NC_016784	GAA	2	6	4093	4098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360694
92	NC_016784	AAAAGA	2	12	4191	4202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	375360694
93	NC_016784	ATT	2	6	4221	4226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375360694
94	NC_016784	GAT	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360694
95	NC_016784	T	6	6	4250	4255	0 %	100 %	0 %	0 %	375360694
96	NC_016784	CAG	2	6	4297	4302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360694
97	NC_016784	ACG	2	6	4306	4311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360694
98	NC_016784	GCTG	2	8	4326	4333	0 %	25 %	50 %	25 %	375360694
99	NC_016784	GAA	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360694
100	NC_016784	GAT	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360694
101	NC_016784	GAT	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360694
102	NC_016784	CAC	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375360694
103	NC_016784	AGTGA	2	10	4542	4551	40 %	20 %	40 %	0 %	375360694
104	NC_016784	GAC	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360695
105	NC_016784	TCG	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360695
106	NC_016784	GAA	2	6	4659	4664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360695
107	NC_016784	GACA	2	8	4671	4678	50 %	0 %	25 %	25 %	375360695
108	NC_016784	GAAA	2	8	4679	4686	75 %	0 %	25 %	0 %	375360695
109	NC_016784	AGT	2	6	4688	4693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360695
110	NC_016784	CCGT	2	8	4695	4702	0 %	25 %	25 %	50 %	375360695
111	NC_016784	AT	4	8	4741	4748	50 %	50 %	0 %	0 %	375360695
112	NC_016784	GAA	2	6	4775	4780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360695
113	NC_016784	AT	3	6	4831	4836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016784	CAG	2	6	4880	4885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360696
115	NC_016784	ATG	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360696
116	NC_016784	TCG	2	6	5007	5012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360696
117	NC_016784	ACA	2	6	5013	5018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375360696
118	NC_016784	CGGT	2	8	5115	5122	0 %	25 %	50 %	25 %	375360696
119	NC_016784	GCC	2	6	5139	5144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375360696
120	NC_016784	TCA	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375360696
121	NC_016784	CGG	2	6	5179	5184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375360696
122	NC_016784	CGG	2	6	5215	5220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375360696
123	NC_016784	CGT	2	6	5242	5247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360696
124	NC_016784	AAC	2	6	5413	5418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375360696
125	NC_016784	AAG	2	6	5583	5588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360696
126	NC_016784	TTGCA	2	10	5646	5655	20 %	40 %	20 %	20 %	375360696
127	NC_016784	ATA	2	6	5697	5702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375360696
128	NC_016784	GGC	2	6	5717	5722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375360696
129	NC_016784	AAG	2	6	5776	5781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360696
130	NC_016784	GAT	2	6	5822	5827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360696
131	NC_016784	GA	3	6	5830	5835	50 %	0 %	50 %	0 %	375360696
132	NC_016784	ATT	2	6	5849	5854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375360696
133	NC_016784	TCT	2	6	5945	5950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360696
134	NC_016784	CTT	2	6	5966	5971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360696
135	NC_016784	GGC	2	6	6034	6039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375360696
136	NC_016784	A	6	6	6041	6046	100 %	0 %	0 %	0 %	375360696
137	NC_016784	TTC	2	6	6115	6120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360696
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150	NC_016784	CTA	2	6	6879	6884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_016784	C	6	6	14460	14465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
277	NC_016784	GAT	2	6	14511	14516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_016784	ATCG	2	8	14572	14579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
279	NC_016784	GA	3	6	14624	14629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
280	NC_016784	TGG	2	6	14645	14650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NC_016784	CGC	2	6	14748	14753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
282	NC_016784	TCA	2	6	14780	14785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_016784	T	6	6	14795	14800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_016784	ATC	2	6	14876	14881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375360698
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407	NC_016784	GAG	2	6	21726	21731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375360703
408	NC_016784	GCT	2	6	21770	21775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360703
409	NC_016784	CCAAG	2	10	21861	21870	40 %	0 %	20 %	40 %	375360703
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438	NC_016784	TAT	2	6	23470	23475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_016784	GGA	2	6	23489	23494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
440	NC_016784	TCC	2	6	23572	23577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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442	NC_016784	T	6	6	23655	23660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_016784	A	7	7	23667	23673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_016784	TTG	2	6	23728	23733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375360705
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484	NC_016784	TA	3	6	26362	26367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_016784	TGAA	2	8	26372	26379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_016784	A	6	6	26415	26420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_016784	CA	3	6	26601	26606	50 %	0 %	0 %	50 %	375360708
495	NC_016784	TGA	2	6	26627	26632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360708
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